在这里我们说的常用腧穴是指在砭术中经常用到的作为体表标志或治疗病症要用到的穴位。下面按经脉顺序排列：
（一）手太阴肺经常用穴位
肺经共有穴位11个，常用到的有8个，它们是中府、云门、尺泽、孔最、列缺、经渠、太渊、鱼际。
（二）手阳明大肠经常用穴位
大肠经共有穴位20个，常用的有11个，它们是商阳、二间、三间、合谷、阳溪、偏历、温溜、曲池、臂臑、肩髃、迎香。
（三）足阳明胃经常用穴位
胃经共有穴位45个，常用的有19个，它们是承泣、颊车、头维、人迎、乳根、天枢、水道、归来、伏兔、梁丘、足三里、上巨虚、下巨虚、丰隆、解溪、冲阳、陷谷、内庭、厉兑。
（四）足太阴脾经常用穴位
脾经共有穴位21个，常用有14个，它们是隐白、大都、太白、公孙、商丘、三阴交、地机、阴陵泉、血海、腹结、大横、腹哀、周荣、大包。
（五）手少阴心经常用穴位
心经共有9个穴位，全部为常用穴。极泉、青灵、少海、灵道、通里、阴郄、神门、少府、少冲。
（六）手太阳小肠经常用穴位
小肠经共有穴位19个，其中12个为常用：少泽、前谷，后溪、腕骨、阳谷、养老、支正、小海、肩贞、天宗、肩外俞、听宫。
（七）足太阳膀胱经常用穴位
膀胱经最长，共有穴位67个，其中常用37个，它们是：晴明、攒竹、玉枕、天柱、大杼、风门、肺俞、心俞、膈俞、肝俞、脾俞、胃俞、肾俞、关元俞、小肠俞、膀胱俞、上髎、次醪、中髎、下醪、承扶、殷门、委阳、委中、膏肓、志室、秩边、承筋、承山、飞扬、昆仑、申脉、金门、京骨、束骨、通谷、至阴。
（八）足少阴肾经常用穴位
肾经共有27个穴位，较常用的有9个，它们是涌泉、然谷、太溪、大钟、水泉、照海、复溜、阴谷、肓俞。
（九）手厥阴心包经常用穴位
心包经共有9个穴位，全部为常用穴：天池、天泉、曲泽、郄门、间使、内关、大陵、劳宫、中冲。
（十）手少阳三焦经常用穴位
三焦经穴位共23个，其中常用14个，它们是关冲、液门、中渚、阳池、外关、支沟、会宗、天井、臑会、肩髎、翳风、角孙、耳门、丝竹空。
（十一）足少阳胆经常用穴位
胆经共有44个穴位，其中常用的有26个，它们是瞳子髎、听会、上关、窍阴、完骨、阳白、（头）临泣、承灵、风池、肩井、日月、京门、带脉、维道、环跳、风市、膝阳关、阳陵泉、外丘、光明、阳辅、悬钟（绝骨）、丘墟、足临泣、侠溪、足窍阴。
（十二）足厥阴肝经常用穴位
肝经共有穴位14个，其中常用的有11个：大敦、行间、太冲、中封、蠡沟、中都、曲泉、阴包、急脉、章门、期门。
（十三）督脉常用穴位
督脉共有28个穴位，常用的仅有9个，它们是长强、命门、至阳、大椎、风府、后顶、百会、上星、人中（水沟）。
（十四）任脉常用穴位
任脉共有24个穴位，常用的有14个，它们是会阴、中极、关元、气海、阴交、神阙（脐中）、下脘、中脘、上脘、巨阙、鸠尾、膻中、天突、承浆。
（十五）经外奇穴
四神聪、印堂、太阳、鼻通、耳尖、安眠（头）、子宫、定喘、八华、胰俞、腰眼、十七椎下、华佗夹脊、十宣、四缝、八邪、落枕、腰痛、二白、扭伤穴、尺桡、失眠（足底）、内踝尖、外踝尖、阑尾点、胆囊点、百虫窝。以上27个经外奇穴在砭术的诊断和治疗中常常用到，并且往往有奇效。